澳门科技大学创新工程学院开设的理学硕士学位课程设置的目标是为二十一世纪培养具有坚实理论基础，宽广专业知识幷具有很强独立工作能力的资讯科技高水准人才。取得理学硕士学位者可以在资讯科技的企业事业单位、政府机关、应用部门从事资讯科技的研究、开发及应用工作。 计算机与资讯系统专业：本专业范畴旨在培养学生了解计算机与资讯系统的各个环节, 对计算机体系结构有较深入的认识, 学习软件工程原理及方法, 数据库的设计与实现, 网络与信息安全, 为他们将来进入计算机与资讯系统领域奠定基础。 通讯工程专业：本专业范畴旨在培养学生了解现代通讯系统与网络的结构, 特别是移动通讯系统与网络, 学会通讯系统的分析与设计，为他们进入通讯领域奠定基础。 太空资讯技术专业：太空资讯技术是资讯科技与太空科学的交叉学科，本专业范畴旨在培养太空资讯技术方面的复合型人才，为学生提供高质量的资讯科技及太空科学的基础理论课程，训练学生掌握太空科学数据的分析方法，为他们进入资讯科技或太空科学领域奠定基础。